COVID-19, известный с начала 2019 года, продолжает мутировать, производя многочисленные штаммы вируса SARS-CoV-2. Болезнь, вызванную различными штаммами, обсуждают медики и общественность, поскольку она вызывает много вопросов. Мы ответим на наиболее важные вопросы, связанные с генетическими вариантами коронавируса.

В микробиологии термин "штаммы" используется для описания культур, полученных из одного и того же источника и в одном месте в одно и то же время. Однако культуры, полученные из того же источника, но в разное время, могут иметь разные штаммы. Хотя микроорганизмы разных штаммов могут принадлежать к одному виду, они различаются между собой. Внутривидовые различия несущественны.

Как пример можно привести коронавирус. Вирус SARS-CoV-2 - виновник последней пандемии COVID-19 - является одним из многих коронавирусов. За время пандемии образовалось несколько штаммов SARS-CoV-2. Эти штаммы различаются между собой геномом, то есть набором генов.

Важно отметить, что вирусы, в том числе и SARS-CoV-2, не являются клетками, а являются носителями генетической информации. Они имеют особую структуру - вирусная частица окружена капсулой и внешней оболочкой, а внутри капсулы находится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим. Его геном закодирован в единственной молекулярной цепи рибонуклеиновой кислоты.

Штаммы образуются в результате генных мутаций, когда дочерние вирусы немного отличаются от родительских по генетическим характеристикам. Штаммы коронавируса отличаются друг от друга по скорости распространения и клиническим проявлениям инфекционного заболевания. Благодаря генетической изменчивости коронавируса образуется устойчивость к иммунной системе и медикаментозным препаратам.

В данной статье мы ответили на основные вопросы, связанные со штаммами коронавируса, их опасностью и мерами предосторожности.

Известно уже множество штаммов коронавируса SARS-Cov-2, каждый из них обозначается отдельной буквой греческого алфавита в соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения. Первоначально штаммы ассоциировались с той страной, в которой они были обнаружены впервые. Например, британский штамм коронавируса был впервые выявлен в Великобритании и получил название "альфа", южноафриканский стал известен как "бета", бразильский - как "гамма", а индийский - как "дельта".

Однако географическая привязка к странам в названии штаммов может вызывать негативную реакцию и включать в обвинения в распространении COVID-19 целые страны. Поэтому ВОЗ предложила новую номенклатурную классификацию, основанную на греческом алфавите. Это не мешает использованию старых названий в медицинских исследованиях.

Но даже в новой классификации есть некоторые нюансы. Штамм коронавируса "омикрон" также получил название греческой буквы. Первоначально, перед ней должны были стоять буквы "ню" и "кси", однако их пропустили. Это связано со страхом вызвать панику у жителей англоязычных стран, если бы штамм назвали "новым", и с антикитайскими настроениями, связанными с ассоциацией буквы "кси" с китайской фамилией Си, которая носит лидер этой страны Си Цзиньпинь.

На начало 2022 года количество штаммов коронавируса, которые отличаются от первоначального, китайского варианта, составляет уже 13.

Вирусные штаммы COVID-19, которые считаются опасными, обладают определенными критериями. Во-первых, они характеризуются высокой контагиозностью, что означает их легкую передачу от человека к человеку. Во-вторых, это вирулентные штаммы, способные вызывать патологические изменения в тканях организма. Кроме того, они приводят к тяжелому течению инфекции, что сопровождается высокой вероятностью осложнений и неблагоприятного исхода болезни. Наконец, опасные штаммы коронавируса устойчивы к действию вакцин и лекарств. Все эти критерии использовались ВОЗ при разработке списка штаммов, вызывающих опасения, – VOC (Variants of Concern). В этот список вошли несколько штаммов, включая альфа-, бета-, гамма- и дельта-штаммы коронавируса. А 26 ноября 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес – VOI (Variants of Interest). Если уровень заболеваемости этими вариантами возрастет, то их переведут в категорию VOC. В список VOI в 2021 году вошли несколько штаммов: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Какова опасность дельта-штамма коронавируса?

Новая индийская вариация коронавируса отличается от классической своей высокой инфекционной способностью. Если в случае COVID-19 каждый пациент заражал от 2 до 3 человек, то в случае дельта-штамма этот показатель возрастает до 5-8. Привнесла ли новая форма изменения в клинический характер заболевания? Индивидуальные особенности клинического течения могут играть роль в увеличении количества заражений. Так, высокая температура часто предупреждает о заражении, но в случае дельта-штамма этот симптом может проявиться не сразу, что делает труднее обнаружить источник инфекции.

Количество вирусов в организме с штаммом дельта-плюс значительно выше по сравнению с классическим COVID-19, поэтому выработка антител требует больше времени и усилий. Усложняется лечение и резко растет вероятность госпитализации пациента. Штамм дельта плюс коронавируса, который является новой модификацией, особенно тяжело протекает и грозит значительным угрозам.

Что отличает британский вариант коронавируса от SARS-CoV-2?

Хотя британская коронавирусная инфекция в целом проявляется так же, как и классическая китайская, есть некоторые отличия в частоте и выраженности симптомов. В частности, боль в горле и кашель чаще встречаются при альфа-штамме – на треть чаще, чем при классическом SARS-CoV-2. Однако у альфа-штамма пациенты теряют обоняние реже – на 39%.

Более того, британский вариант вируса на 90% заразнее, а болезнь протекает тяжелее. Частота госпитализации в случае альфа-штамма выше на 64%, что повышает риск неблагоприятного исхода. Но, к счастью, на территории РФ уровень заболеваемости британским штаммом не слишком высок.

На текущий момент выделены несколько вариантов коронавируса – альфа, бета, гамма, дельта – каждый из которых отличается некоторыми признаками. О том, чем именно отличаются эти варианты, можно узнать на сайте ЭЛ КЛИНИКА.

С начала осени текущего года всеобщее внимание устремлено на очередной штамм коронавируса южноафриканского происхождения, который стал известен как омикрон. Он был выявлен впервые в ноябре 2021 года и продолжает вызывать у людей все большую тревогу по всему миру. Омикрон очень заразен и каждый день побивает новые рекорды по заболеваемости. Ученые сообщают, что если раньше COVID-19 преимущественно поражал пожилых и ослабленных людей с другими заболеваниями, то новый вирус начал атаковать даже детей.

Несмотря на то, что пока нет единого мнения среди специалистов относительно тяжести протекания инфекции и возможности неблагоприятных исходов, лабораторные исследования показали, что омикрон-штамм реже попадает в легкие и чаще поражает носоглотку, что значительно упрощает его передачу воздушно-капельным путем. Возможно, это и есть одна из причин за высокую заболеваемость.

Согласно данным, которыми располагают ученые, число летальных исходов от омикрона пока находится на уровне 0,1-0,2%, что примерно соответствует уровню смертности от других штаммов. Для получения более подробной информации о новом штамме коронавируса рекомендуем обратиться к биологу Константину Северинову, который дал ответы на 10 вопросов об омикрон-штамме в рамках интервью для журнала "РБК".

Как понять, что вы заболели одним из вариантов коронавируса? Это вопрос, на который чрезвычайно важно знать ответ в наше непростое время. Каждый штамм вируса имеет свои особенности. Некоторые варианты могут вызывать болезнь с легким течением, а другие - гораздо более опасные последствия. Также существуют штаммы, которые нападают на конкретную возрастную категорию, в то время как другие могут поразить любого человека.

Когда вы подозреваете, что заболели, учитывать все особенности вируса не стоит. Поэтому объективная диагностика является важной процедурой для определения генетического варианта SARS-CoV-2. Для этого специалисты проводят полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с последующим секвенированием, то есть изучением вирусного генома в лабораторных условиях. В результате исследования можно определить последовательность генов в молекулярной цепи. Сложное оборудование, используемое при диагностике, требует специальной квалификации. Однако сама процедура взятия мазка из носоглотки и ротоглотки проста и может быть выполнена как в клинике, так и на дому. Результат ПЦР готов через несколько часов и считается практически абсолютно достоверным. По этой причине, ПЦР является «золотым стандартом» для диагностики инфекции COVID-19.

Это первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2, и ее разработка была описана на информационном портале о генетике GENETICS.

Вопрос о том, сохраняется ли иммунитет у человека после перенесенного коронавируса к другим его штаммам, остается открытым. После первого заражения в крови образуются антитела, которые пытаются уничтожить новые заражения. Однако возможно, что мутировавший коронавирус может плохо связываться с антителами, поэтому иммунная система может уничтожать не все, а лишь некоторые штаммы вируса.

Кроме того, временной фактор тоже имеет огромное значение. Со временем количество циркулирующих антител в крови уменьшается. Это означает, что эффективность защиты от последующих инфекций также может быть разной, в зависимости от времени, когда повторное заражение произошло, состояния иммунитета и вида мутации. В общем, ответ на вопрос о том, сохраняется ли иммунитет после перенесенного коронавируса, не является однозначным.

Фото: freepik.com